Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Kif3cO35066 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Kif3cO35066 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms