Protein–RNA interactions for Protein: O09117

Sypl1, Synaptophysin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl1O09117 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sypl1O09117 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sypl1O09117 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sypl1O09117 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sypl1O09117 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Sypl1O09117 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sypl1O09117 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sypl1O09117 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Sypl1O09117 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sypl1O09117 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sypl1O09117 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sypl1O09117 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sypl1O09117 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sypl1O09117 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sypl1O09117 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sypl1O09117 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sypl1O09117 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sypl1O09117 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sypl1O09117 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sypl1O09117 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sypl1O09117 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sypl1O09117 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sypl1O09117 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sypl1O09117 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sypl1O09117 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sypl1O09117 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Sypl1O09117 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Sypl1O09117 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms