Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gfra2O08842 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms