Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna5O08543 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna5O08543 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna5O08543 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efna5O08543 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efna5O08543 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna5O08543 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Efna5O08543 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms