Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
MsmbO08540 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
MsmbO08540 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
MsmbO08540 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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