Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gm21310J3QQ23 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gm21310J3QQ23 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gm21310J3QQ23 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
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Gm21310J3QQ23 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm21310J3QQ23 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm21310J3QQ23 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Gm21310J3QQ23 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm21310J3QQ23 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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