Protein–RNA interactions for Protein: J3QP80

Gm5814, MCG15559, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5814J3QP80 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm5814J3QP80 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm5814J3QP80 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm5814J3QP80 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm5814J3QP80 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms