Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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Gm21972J3QN38 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Gm21972J3QN38 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Gm21972J3QN38 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Gm21972J3QN38 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Gm21972J3QN38 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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