Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm3415J3QMS8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Gm3415J3QMS8 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm3415J3QMS8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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