Protein–RNA interactions for Protein: J3QMM8

Gm7971, Predicted gene 16429, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm7971J3QMM8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm7971J3QMM8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm7971J3QMM8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Gm7971J3QMM8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm7971J3QMM8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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