Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gm20828J3KMI7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms