Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Taf4bG5E8Z2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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