Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arfip1G5E8V9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms