Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Vmn1r34G3XA52 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Vmn1r34G3XA52 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms