Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Vmn1r58G3X9U3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Vmn1r58G3X9U3 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms