Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Z7

Chrna9, Cholinergic receptor, nicotinic, alpha polypeptide 9, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna9G3X8Z7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Chrna9G3X8Z7 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Chrna9G3X8Z7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms