Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM2

Ccl26, Chemokine (C-C motif) ligand 26, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl26F8VQM2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ccl26F8VQM2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ccl26F8VQM2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ccl26F8VQM2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ccl26F8VQM2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ccl26F8VQM2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ccl26F8VQM2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ccl26F8VQM2 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ccl26F8VQM2 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccl26F8VQM2 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms