Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Srp72F8VQC1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Srp72F8VQC1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Srp72F8VQC1 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Srp72F8VQC1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Srp72F8VQC1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Srp72F8VQC1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Srp72F8VQC1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Srp72F8VQC1 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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