Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Usp9yF8VPU6 Fuom-203ENSMUST00000121115 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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