Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm3371F7CQW8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gm3371F7CQW8 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms