Protein–RNA interactions for Protein: F6U473

Gm28305, Predicted gene 28305 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28305F6U473 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Gm28305F6U473 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms