Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lmod3E9QA62 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lmod3E9QA62 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms