Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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Rdh16f1E9Q9P8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rdh16f1E9Q9P8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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