Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

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Length 693 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TrdnE9Q9K5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TrdnE9Q9K5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TrdnE9Q9K5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TrdnE9Q9K5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TrdnE9Q9K5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TrdnE9Q9K5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
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TrdnE9Q9K5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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TrdnE9Q9K5 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
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TrdnE9Q9K5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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TrdnE9Q9K5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
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TrdnE9Q9K5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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TrdnE9Q9K5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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TrdnE9Q9K5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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TrdnE9Q9K5 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TrdnE9Q9K5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
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