Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5407E9Q7Q1 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5407E9Q7Q1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5407E9Q7Q1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5407E9Q7Q1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5407E9Q7Q1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5407E9Q7Q1 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5407E9Q7Q1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm5407E9Q7Q1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5407E9Q7Q1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5407E9Q7Q1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gm5407E9Q7Q1 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Gm5407E9Q7Q1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Gm5407E9Q7Q1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm5407E9Q7Q1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm5407E9Q7Q1 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm5407E9Q7Q1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Gm5407E9Q7Q1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gm5407E9Q7Q1 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gm5407E9Q7Q1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gm5407E9Q7Q1 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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Gm5407E9Q7Q1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm5407E9Q7Q1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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