Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate1E9Q658 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate1E9Q658 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pate1E9Q658 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pate1E9Q658 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Pate1E9Q658 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate1E9Q658 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms