Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtproE9Q612 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtproE9Q612 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtproE9Q612 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtproE9Q612 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtproE9Q612 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtproE9Q612 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtproE9Q612 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtproE9Q612 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtproE9Q612 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtproE9Q612 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtproE9Q612 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtproE9Q612 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PtproE9Q612 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PtproE9Q612 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtproE9Q612 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtproE9Q612 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtproE9Q612 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtproE9Q612 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtproE9Q612 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtproE9Q612 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtproE9Q612 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtproE9Q612 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
PtproE9Q612 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
PtproE9Q612 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PtproE9Q612 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms