Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5E2

BC005561, cDNA sequence BC005561, mousemouse

Predictions only

Length 1,589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC005561E9Q5E2 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BC005561E9Q5E2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
BC005561E9Q5E2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms