Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Pdzd2E9Q1M1 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms