Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Krt78E9Q0F0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Krt78E9Q0F0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms