Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm20425E9Q035 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms