Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC9.46□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
Ryr1E9PZQ0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm8325-201ENSMUST00000099086 453 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ryr1E9PZQ0 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC9.44□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms