Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rsf1E9PWW9 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rsf1E9PWW9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms