Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc8E9PWG2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc8E9PWG2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms