Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ccdc144bE9PVZ3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc144bE9PVZ3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms