Protein–RNA interactions for Protein: E9PV04

Gm8994, Predicted gene 8994, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8994E9PV04 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm8994E9PV04 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms