Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SafbD3YXK2 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SafbD3YXK2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SafbD3YXK2 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SafbD3YXK2 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SafbD3YXK2 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SafbD3YXK2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SafbD3YXK2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SafbD3YXK2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SafbD3YXK2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms