Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Samd1D3YXK1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Samd1D3YXK1 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms