Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Gm20547B8JJN0 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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Gm20547B8JJN0 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm20547B8JJN0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm20547B8JJN0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm20547B8JJN0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm20547B8JJN0 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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Gm20547B8JJN0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Gm20547B8JJN0 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm20547B8JJN0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm20547B8JJN0 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm20547B8JJN0 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm20547B8JJN0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Gm20547B8JJN0 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm20547B8JJN0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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