Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pnldc1B2RXZ1 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms