Protein–RNA interactions for Protein: B2RXA7

Cyp26c1, Cytochrome P450, family 26, subfamily c, polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26c1B2RXA7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cyp26c1B2RXA7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms