Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm26871-204ENSMUST00000181310 523 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Apba1B2RUJ5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 4933405E24Rik-201ENSMUST00000131019 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Gm3344-201ENSMUST00000169610 603 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Apba1B2RUJ5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms