Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PtprbB2RU80 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PtprbB2RU80 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PtprbB2RU80 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PtprbB2RU80 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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PtprbB2RU80 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PtprbB2RU80 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms