Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Brpf1B2RRD7 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Brpf1B2RRD7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms