Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc2B2RR83 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc2B2RR83 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms