Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slfn8B1ARD8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Slfn8B1ARD8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Slfn8B1ARD8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slfn8B1ARD8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms