Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm3173A6NAS3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms