Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Odf2A3KGV1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Odf2A3KGV1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms