Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Atp8b5A3FIN4 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Atp8b5A3FIN4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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