Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Scn3aA2ASI5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Scn3aA2ASI5 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms